Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx2Q04744 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emx2Q04744 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx2Q04744 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Emx2Q04744 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Emx2Q04744 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Emx2Q04744 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Emx2Q04744 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Emx2Q04744 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms