Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms