Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cxcr5Q04683 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cxcr5Q04683 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cxcr5Q04683 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cxcr5Q04683 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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