Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms