Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms