Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms