Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms