Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms