Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcqQ02111 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms