Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme2Q01768 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms