Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms