Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms