Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms