Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfaQ00731 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms