Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp4Q00724 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rbp4Q00724 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rbp4Q00724 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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