Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SeleQ00690 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms