Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms