Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms