Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms