Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp10Q000W5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms