Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms