Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
rp9P97762 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
rp9P97762 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
rp9P97762 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
rp9P97762 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
rp9P97762 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
rp9P97762 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
rp9P97762 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
rp9P97762 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
rp9P97762 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
rp9P97762 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
rp9P97762 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
rp9P97762 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
rp9P97762 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
rp9P97762 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
rp9P97762 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
rp9P97762 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
rp9P97762 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
rp9P97762 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
rp9P97762 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
rp9P97762 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
rp9P97762 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
rp9P97762 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
rp9P97762 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
rp9P97762 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
rp9P97762 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
rp9P97762 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
rp9P97762 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
rp9P97762 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
rp9P97762 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
rp9P97762 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms