Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms