Protein–RNA interactions for Protein: P97382

Kcnab3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab3P97382 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnab3P97382 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab3P97382 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms