Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms