Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

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Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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