Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mesp1P97309 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms