Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms