Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcdP82347 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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