Protein–RNA interactions for Protein: P70441

Slc9a3r1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r1P70441 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r1P70441 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r1P70441 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r1P70441 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r1P70441 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r1P70441 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r1P70441 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r1P70441 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r1P70441 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a3r1P70441 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a3r1P70441 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a3r1P70441 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a3r1P70441 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a3r1P70441 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a3r1P70441 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc9a3r1P70441 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms