Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
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Usp9xP70398 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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