Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms