Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms