Protein–RNA interactions for Protein: P70206

Plxna1, Plexin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 1,894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna1P70206 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Plxna1P70206 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna1P70206 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms