Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms