Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms