Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcbP68404 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms