Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Crip1P63254 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Crip1P63254 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Crip1P63254 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Crip1P63254 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Crip1P63254 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms