Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms