Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms