Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou3f4P62515 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms