Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp46P62069 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp46P62069 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp46P62069 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp46P62069 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp46P62069 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp46P62069 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp46P62069 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp46P62069 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp46P62069 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp46P62069 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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