Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lmo4P61969 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms