Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga11P61622 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms