Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ActbP60710 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ActbP60710 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ActbP60710 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ActbP60710 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ActbP60710 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ActbP60710 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ActbP60710 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ActbP60710 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ActbP60710 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ActbP60710 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms