Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms