Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms