Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhbdl3P58873 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms