Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms