Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms